При Конференції єпископів України діють такі комісії:
- комісія у справах Віровчення – архієпископ Мечислав Мокшицький (від 5 XI 2008)
- катехетична комісія – єпископ Леон Дубравський (від 5 XI 2003)
- комісія у справах кліру та священницьких покликань – єпископ Віталій Скомаровський (від 1 XII 2018)
- комісія у справах літургії та сакрального мистецтва – єпископ Яцек Пиль ОМІ (від 15 XI 2013), єпископ Станіслав Широкорадюк OFM (від 15 XI 2013)
- комісія душпастирства родин – єпископ Радослав Змітрович ОМІ (від 15 XI 2013; від 1 XII 2018 також служить асистентом руху «Світло-Життя»)
- комісія загального душпастирства – єпископ Ян Собіло (від 15 XI 2013)
- комісія у справах чоловічих орденів та згромаджень – єпископ Едвард Кава OFMConv (від 1 XII 2017)
- комісія у справах жіночих орденів та згромаджень – єпископ Едвард Кава OFMConv (від 1 XII 2018)
- комісія душпастирства молоді – єпископ Ян Собіло (від 1 XII 2018)
- комісія «Церква-Держава» – єпископ Віталій Кривицький SDB (від 1 XII 2017)
- комісія «Карітас-Спес» – єпископ Станіслав Широкорадюк OFM (від 13 X 1998; від 26 V 1995 очолював харитативну комісію)
- екуменічна комісія – єпископ Віталій Кривицький SDB (від 1 XII 2018)
- комісія у справах інтегрального розвитку людини – єпископ Леон Малий (від 1 XII 2018)
- комісія у справах засобів масової комунікації – єпископ Віталій Кривицький SDB (від 1 XII 2018)
- комісія військового душпастирства – єпископ Станіслав Широкорадюк (від 1 XII 2018)
Президент «Карітас-Спес» – о. Петро Жарковський (від 28 V 2016)
Речник КЄУ – єпископ Віталій Скомаровський (від 5 XI 2008)
Віцеречник – о. Олександр Зелінський ОМІ (від 1 XII 20018)